Ce comportement est casi normal, ta chienne est chez elle depuis pas mal de temps, c'est son territoire et sa maîtraisse était jusqu'à présent pour elle toute seule. En plus tu dis qu'elle à eu un passé difficile, cela dépend aussi de ce qu'elle à vécue.
Le petit nouveau est un chiot, d'instinct, je pense que tu est attiré vers lui un peu plus, un chiot demande de l'affection, même si tu le fais pas exprès, mais ta chienne le ressent.
Il faut lui laisser du temps, mais aussi lui montrer que tu est toujours là pour elle. Ne pas être agressif envers elle, au contraire, elle doit sentir que tu tiens à elle comme avant.
Souvent le temps apaise, le temps que tous s'adaptent à la situation. Mais il est vrai que certaines fois cela ne suffise pas, certains chiens ne sont pas fait pour vivres ensembles, comme cela peut aussi arriver chez les humains. Mais je pense qu'il lui faut certainement du temps pour s'adapter.