Bonsoir,
La chatte défend ses petits, elle obéit à son instinct qui lui dicte que les mâles sont dangereux pour les petits. Possible qu'il ait eu un comportement récemment que vous n'avez pas vu, genre lécher les petits par exemple, en laissant son odeur sur eux, ce qui inquiète la mère.
Le mieux est de cloisonner afin que le mâle n'ait pas accés aux petits. Sachez que la mère peut très vite se retrouver à nouveau gestante, mais sans aucun signe visible de chaleurs.